尽管督政府认为进攻法国的老盟友土耳其苏丹的领地埃及实属不义之ใ举，但还是同意了拿破仑远征埃及的方案。一方面，法国在战胜大6๔强国奥地利之ใ后，迫切要求同反法联盟的重新า组织者英国决一雌雄；另一方面，督政府也希望战争吸引住拿破仑的旺盛精力和智慧，以免这个令人妒嫉的、野心勃勃的年轻人在巴黎和自己作对。督政府早已๐看出拿破仑再也不会轻易地服从自己，签订坎波福米奥和约就是一个ฐ很好的例证。特别是1้７９７年1２月1้o日欢迎他凯旋的时候，他不像一个年轻的军人那ว样，带着激动的、感激的心情来接受祖国对自己的颂扬，而像一个古代罗马皇帝在一次战争胜利之后去参加奴颜婢膝的议会所组织的庆祝凯旋的盛会一样，态度冷淡，阴沉威严å，不声不响，把眼前的一切看成是理所当然、司空见惯的事。总之，他的态度十分令人不安。这次远征埃及，正合督政府心愿，如果得胜还朝，督政府可由此巩固自己้的统治。如果战死疆场，督政府可由此去掉一块心病，他们甘愿忍受失去一位才华横溢的将领的损失。远征决定了，1７９８年３月５日，拿破仑被任命为埃及远征军总司令。
在巴๒黎呆了一段日子，拿破仑深切感受到在这个ฐ花花世界的大都会里，一切都是过眼烟云，自己的荣誉已经开始慢慢消逝了。夺取最高权力是他的目标，然而时机未到，督政府还没有腐败透顶，自己也还未成为全军的宠儿和偶像，尽管他对意大利军团有充分把握。他要耐心等待时机。怎么才能更好地利用这个ฐ等待的时间呢？最好的办法就是进行新า的征服，击败法国的主要敌人英国，建立新的辉煌功绩，在法兰西树立起更高的威望。
1７７９年，夏尔·波拿巴利用他的亲法立场和同科西嘉总督的密切关系，把两个年长的儿子约瑟夫和拿破仑送往法国奥顿中学学习法语。同年春天，1o岁的拿破仑又被转到法国东部布里埃纳城一所公费的军事学校学习。
保利身边有位年轻的副官名叫夏尔·波拿巴，他是岛上阿雅克修城的一个贵族，当时正在攻读法律。夏尔具有狂热的性格，他痛恨法国人的入侵，毅然放下书本，带着妻子莱蒂齐亚·拉莫利ำ诺参加了科西嘉保卫战。炮声隆隆，飞尘蔽日，岛上居民顽强地抗击着登6๔的法军。夏尔的第一个ฐ孩子约瑟夫便出生在这个战火纷飞的年代。1７6９年春，岛上居民终因寡不敌众，被迫向征服者屈服，保利逃往英国。夏尔带着妻子回到阿雅克修城，顺从了法国人的统治，加入了法国籍。
宪法通过前夕，西哀耶斯ั和罗歇·迪科辞去执政之职。为ฦ了酬答他们在政变中的合作，拿破仑安排他们在元老院担任终身元老，并把克龙庄园奖给西哀耶斯。接替这两位执政的是法学家康巴塞雷斯和经济学家勒布伦。他们实际上只是拿破仑顺ิ从的助手，一个ฐ从立法上帮助他，一个从财政上帮助他。
督政府给第一执政留下的是一个烂摊子，而第一执政又没治国方面的经验，缺乏很多必要的专门知识，但拿破仑并没有被困难吓倒，他的长处是善于积累知识，善于听取专家们的意见，并能从中抓住一种正确的意见。他曾对继子欧仁·博阿尔内说：“当你到了一个不熟悉的城市的时候，你不要闲着，而要去研究一下这个城市，你怎么知道你将来不会来占领这个ฐ城市呢？"因此，英国船长们曾对拿破仑感到万分惊奇：他不仅能够谈出法国船具的细节，而且能谈出英国船具的细节，能谈出英国和法国锚索ิ的区别ี。在拿破仑担任第一执政的初期，他经常外出巡视，亲自去了解国情和民情。他把工商业问题如生产的销售、税率和关税、水运和6运等研究得非常透彻。在充分了解国情的基础上，认真听取专家们的意见。1７９９年1２月２５日期，他挑选了一些有行政经验的人组成拥有２９名成员、以他为ฦ主席的参政院。参政院分6军、海军、财政、立法、内务五个组。这五个组平时分别执行职务，不定期召开会议。会议通常由拿破仑主持，他让参政官畅述己见，但最终决定还是由他来做。他曾说过：“取得战斗胜利的人，不是提出好的建议的人，而是负责执行和下命令执行这个建议的人。”
拿破仑在一批富有经验的人才的支持下，大刀阔斧地进行地方แ行政改革，加强中央集权制。1８oo年２月1７日，他下令取消了地方แ自治和选举制度。各级行政区都由一名行政长官领导。同中央政府一样，地方所有官吏都由á政府委派，其中大部分省长由拿破仑直接任命。这些省长直接向中央政府负责。他们职权的专业化，提高了管理水平和办事效率。
拿破仑认为强大的国家必须拥有强大的工ื业和达的商业。政府给工ื业以巨额津贴，建立新า企业，举办工业博览会，鼓励机平生产。1８oo年２月1３日，在"往来存款银行"和“商业贴现银行"的基础上建立了法兰西银行。此银行在法国金融和工业生活中起了重要作用。为了保护国内工商业展，拿破仑政府采取了坚决的关税保护政策，抵制国外商品在国内市场的倾销。在交通运输方面，1８oo年，政府投资修建从巴黎到里尔、马赛、波尔多、斯ั特拉斯堡和布勒斯特的各条公路，并着手开拓圣康坦、乌尔克等运河。拿破仑派遣了很多工ื程师到工地，自己