总司令立即展开了繁忙的准备工ื作：巡视海岸和海军、组织远征兵团、研究世界ศ政治局势的一切动态以及英国纳尔逊舰队活动的一切消息。拿破仑几乎ๆ是一个个ฐ地选拔远征埃及的士兵。他认识很多士兵，他有着极为惊人的记忆力，他知道哪个士兵勇敢、坚强，但经常饮酒；哪个士兵很聪明、灵敏，但容易疲劳，因为有疝气病。为ฦ了使他的军队能在烈火般的阳光下作战，能走过炎热的、一望无边的荒芜的干旱ທ沙漠，他必须挑选能吃苦耐劳、身体健壮的士兵。他还挑选了一批高级军官，贝尔蒂埃继续担任他的参谋长，布律埃斯海军上将担任舰队司令。除此之外，还有克莱贝尔、狄舍、拉纳、贝西埃尔、缪拉、朱诺、达武、马尔蒙等一批著名将军。约瑟芬与前夫的儿子欧仁·博阿尔内也作为拿破仑的随从副官一同前往。
在巴黎呆了一段日子，拿破仑深切感受到在这个ฐ花花世界的大都会里，一切都是过眼烟云，自己的荣誉已经开始慢慢消逝了。夺取最高权力是他的目标，然而时机未到，督政府还没有腐败透顶，自己也还未成为全军的宠儿和偶像，尽管他对意大利军团有充分把握。他要耐心等待时机。怎么才能更好地利用这个等待的时间呢？最好的办法就是进行新的征服，击败法国的主要敌人英国，建立新的辉煌ä功绩，在法兰西树立起更高的威望。
布里埃纳军校并不是一个令人心旷神怡的地方。那里的纪律异常严厉，老同学总是虐待新学员。这个来自科西嘉、穿着破旧的拿破仑顿ู时成为法国贵族子弟的嘲弄对象。他们嘲笑他的科西嘉口音和他那被海风吹得黝黑的皮肤，嘲笑他那贫穷的贵族出身。小小的拿破仑怒不可遏，同那ว些被他称作为"高贵的小丑"ิ们打了几架，那些贵族子弟这才现这个小个子的拿破仑也不是好惹的。
保利ำ身边有位年轻的副官名叫夏尔·波拿巴，他是岛上阿雅克修城的一个ฐ贵族，当时正在攻读法律。夏尔具有狂热的性格，他痛恨法国人的入侵，毅然放下书本，带着妻子莱蒂齐亚·拉莫利诺参加了科西嘉保卫战。炮声隆隆，飞尘蔽日，岛上居民顽ื强地抗击着登6的法军。夏尔的第一个孩子约瑟夫便出生在这个ฐ战火纷飞的年代。1７6９年春，岛上居民终因寡不敌众，被迫向征服者屈服，保利逃往英国。夏尔带着妻子回到阿雅克修城，顺从了法国人的统治，加入了法国籍。
宪法通过前夕，西哀耶斯和罗歇·迪科辞去执政之ใ职。为了酬答他们在政变中的合作，拿破仑安排他们在元老院担任终身元老，并把克龙庄园奖给西哀耶斯。接替这两位执政的是法学家康巴塞雷斯和经济学家勒布伦。他们实际上只是拿破仑顺ิ从的助手，一个ฐ从立法上帮助他，一个从财政上帮助他。
督政府给第一执政留下的是一个烂摊子，而第一执政又没治国方面的经验，缺乏很多必要的专门知识，但拿破仑并没有被困难吓倒，他的长处是善于积累知识，善于听取专家们的意见，并能从中ณ抓住一种正确的意见。他曾对继子欧仁·博阿尔内说：“当你到เ了一个ฐ不熟悉的城市的时候，你不要闲着，而要去研究一下这个ฐ城市，你怎么知道你将来不会来占领这个城市呢？"因此，英国船长们曾对拿破仑感到万分惊奇：他不仅能ม够谈出法国船具的细节，而且能ม谈出英国船具的细节，能谈出英国和法国锚索ิ的区别。在拿破仑担任第一执政的初期，他经常外出巡ำ视，亲自去了解国情和民情。他把工ื商业问题如生产的销售、税率和关税、水运和6运等研究得非常透彻。在充分了解国情的基础上，认真听取专家们的意见。1７９９年1２月２５日期，他挑选了一些有行政经验的人组成拥有２９名成员、以他为主席的参政院。参政院分6军、海军、财政、立法、内务五个ฐ组。这五个组平时分别ี执行职务，不定期召开会议。会议通常由拿破仑主ว持，他让参政官畅ม述己见，但最终决定还是由他来做。他曾说过：“取得战斗胜利的人，不是提出好的建议的人，而是负责执行和下命令执行这个建议的人。”
拿破仑在一批富有经验的人才的支持下，大刀阔斧地进行地方行政改革，加强中央集权制。1８oo年２月1７日，他下令取消เ了地方自治和选举制度。各级行政区都由一名行政长官领导。同中央政府一样，地方所有官吏都由政府委派，其中大部分省长由拿破仑直接任命。这些省长直接向中央政府负责。他们职权的专业化，提高了管理水平和办事效率。
拿破仑认为强大的国家必须拥有强大的工业和达的商业。政府给工业以巨额津贴，建立新企业，举办工业博览会，鼓励机平生产。1８oo年２月1３日，在"往来存款银行"和“商业贴现银行"的基础上建立了法兰西银行。此银行在法国金融和工业生活中起了重要作用。为ฦ了保护国内工ื商业展，拿破仑政府采取了坚决的关税保护政策，抵制国外商品在国内市场的倾销。在交通运输方面，1้８oo年，政府投资修建从巴黎到里尔、马赛、波尔多、斯特拉斯堡和布勒斯特的各条公路，并着手开拓圣康坦、乌ไ尔克等运河。拿破仑派遣了很多工程师到เ工地，自己也经常去那里，同工ื程师们一道拟订开拓方案。这一切加了法国资本主义的展。
身为第一执政的拿破仑这时更加认识到人心向背对一个ฐ政权巩固的重要性。为了笼络人心，他在卢森堡宫向荣立战功的官兵授予荣誉马刀和步枪。在第一批被授予马刀的官兵中，有一个ฐ叫莱翁·奥纳的掷弹兵军士，他获准上书第一执政表示谢意，拿破仑立即复信道：“我收到了你的信，我勇敢的同志；你无须提醒我你的英勇行为；自从勇敢的班纳赛特死后，你是军中最勇敢的掷弹兵。你领ๆ取了我分授的1oo把马刀中的一把，谁都同意，你是最当之无愧。我很想再见到你，6军部长下令让你前来巴黎。"这封信在全军流传，法国最伟大的将军、第一执政称呼一个军士为他的勇敢的同志，这种平等的态度使整个军队热情高涨。
拿破仑这种笼络人心的手段同样也运用在文官中。拿破仑素以精力旺盛、不知疲倦而著称，他每天除了几个小时睡眠、1５分钟的午餐和不到1้５分钟的早餐时间外，其余时间全部ຖ都用来工作。他也以这个标准去要求别人。在他身边的每个人不得不出一切限度来工作，然而，没有人对此抱怨。一个曾在拿破仑时期长期任职的官员说：“拿破仑有一种用亲昵而毫不拘礼的态度来提高人们对事业的忠诚的本事。他在必要的场合下，善于用这种态度来对待下级，像对待平级的人一样。"这种本事使人们产生激情，就像他在军队里使官兵产生激情一样。人们在工作中累็得精疲力尽，就像官兵们在战场上牺牲一样，毫无怨言。文官们也像武官们一样，为了得到一枚勋章或主宰的一个微笑，而不惜赴汤蹈火。
大权独揽的拿破仑也有因意气用事而作出错误决定的时候，但性格倔强的拿破仑什么เ时候也不走回头路，即使明知是一个不公正的决定，他也不会立即去改正它。在他初为执政时就生过这样一件事。
1７９９年春拿破仑在埃及时，督政府曾把曼图亚城防司令一职授予拉图尔·弗阿萨将军。拉图尔担任这一重要职务不久ื，奥军便来围攻曼图亚。７月间，拉图尔将军向奥军投降，曼图亚失守。督政府怀疑拉图尔将军暗通奥军，便下令军事法庭调查这位将军的行径。拉图尔回到法国后，立即为失守曼图亚辩解。拿破仑升任执政后，听说这一案件，气愤异常。曼图亚是他蒙受了巨大牺牲才拿下的，如今却失守在这位将军的手里，不能ม不心痛。他不等拉图尔的罪责得到证明，便停止了军事法庭的调查，宣布拉图尔有罪，并布了一道针ฤ对他的激烈法令。这一专断ษ的决定引起了众多将领的不满，他们不由得担心日后一旦失欢于第一执政，也会因第一执政的一句话而断ษ送前程和生命。事后，平静下来的拿破仑开始觉得自己้的决定有些过激，他的秘书也指出他的做法不妥，劝他改正这一决定，但拿破仑答道：“也许你说的对。可是事情已经做了，法令已经布。我向每个人都这样说明，我不能回转脚步。后退就是失败。我不能承认有错误。过些日子我们再看怎么เ补救吧。”
这个ฐ时期，卢森堡宫办了一件喜事，那就是拿破仑的妹妹卡罗利娜与缪拉将军举ะ行了结婚典礼ึ。缪拉虽出身低微，但举止文雅，风度高贵，深得执政夫人约瑟芬的喜爱。当时有人传说约瑟芬与缪拉有暧昧关系，为了证明这纯属谣言，约瑟芬极力劝说拿破仑将妹妹卡罗利娜嫁给缪拉。拿破仑很高兴看到妻子对这门亲事如此热心，便欣然同意了。卡罗利娜与缪拉很快就举行了婚礼。
拿破仑虽为ฦ第一执政，但他的野心并未得到满足，执政府只不过是迈向君主制ๆ的一个步骤。卢森堡宫变得太小，容纳不下政府脑，拿破仑决定要搬到法国历代国王的寝宫杜伊勒里宫去住了。
迁出卢森堡宫那ว天，拿破仑神情得意地对布里昂说：“我们到底要睡到杜伊勒里宫去了。我一定要排列仪仗前往。这本不是我喜欢的，但是我们必须铺张一番，因为百姓喜欢。督政府太简朴了，因此没有威信。简朴在军队是适当的，但在一个大城市，在一座宫殿，国家脑必须用一切可能的办法引人注目。”
1时整，拿破仑离开卢森堡宫。３ooo名精选士兵以齐整划ฐ一的步伐在乐队高奏声中行进。将官和他们的幕僚骑马，各部ຖ部长乘๖车。独有执政乘的马车由6匹白马拉曳，令人想起光荣与和平。这些漂亮的马匹是坎波福米奥条约缔结后德国皇帝赠送给拿破仑的。拿破仑还佩带着弗兰西斯皇帝ຓ馈赠他的贵重马刀。与第一执政同乘一辆马车的是另二位执政康巴塞雷斯和勒布伦。通往杜伊勒里宫的各条大道上都有卫队夹道欢迎，民众的欢呼声不绝于耳。
军队在杜伊勒里宫前面的广场上列队。第一执政下了马车，纵身上马，检阅部队。周围挤满了看热闹的群众，还有许多衣着优雅的妇女，他们异口同声地高呼：“第一执政万岁！”拿破仑缓缓地走过各个团队，向他们说了许多鼓舞士气的话。然后，他在接近杜伊勒里宫大门处就位，右侧有缪拉，左侧是拉纳，背后站立着大批年轻的勇士，他们的颜面已被埃及和意大利ำ的太阳晒得黝黑。在这里还悬挂着第９３、４３和３o等几个残旅的军旗，这些旗帜只剩下一根光秃秃的旗杆，上面挂了几条已被硝烟熏黑的弹痕累็累的碎片。拿破仑对着军旗脱帽鞠躬致敬，顿ู时赢得了成千上万的人同声喝彩。军人排成单人纵列后，拿破仑正步跨进了杜伊勒里宫的大门。
平定内乱
督政府末期，在法国南部和中ณ部所有道路上强盗盛行。这些强盗在光天化日之下，拦路抢劫，杀害公众，袭击村庄，用火刑拷打被捉住的人，要他们供出钱藏在什么地方。他们打着为波旁้王朝复仇的旗号，无恶不作。拿破仑上台后，决定肃清这批匪帮。拿破仑颁แ布命令：不抓俘虏，一律就地镇法。窝藏盗匪或者购买赃物者，或者与盗匪有联系者，一律处死。他派出大量军队，这些军队毫不留情地镇压了直接罪犯及其帮凶，并镇压那些姑息纵容的警官。
与此同时，旺代等地的王党活动非常猖獗。王党叛乱正在诺曼底、布列塔尼、旺代等地迅蔓延，一部分农民也被吸引到王党的叛乱队伍中。他们利用英国人从海上给他们提供的最好武器，借助森林和沼泽地带，进行长期的游击战争，反对一切革命政府。拿破仑对叛乱分子采取了软硬两手策略，他一面派出军队进攻叛乱分子，一面答应对立即放下武器的人实行特赦。这对分化瓦解叛乱ກ队伍起了很大作用。1７９９年11月２４日，埃杜维尔将军代表法国当局同叛乱分子领ๆ缔结了第一次停战协定。叛乱ກ分子为了进一步摸清拿破仑的意图，看看拿破仑能ม否出来支持他们的复辟活动，便派代表前往巴黎同拿破仑会面。双方就不在叛乱ກ地区征兵、欠税延期缴纳和归还逃亡者尚未拍卖的财产等方面达成协议。拿破仑一方面表示"我不是王党分子"，另一方แ面又说：“十年来，法国人的血流得够多了"，表示了和解的愿望。最后，拿破仑表示希望要同著名的叛乱领乔治·卡杜达尔进行单独会谈，并保证他在巴黎期间的人身绝对安全。
这个身材高大、刚健有力的叛乱领终于来到巴黎，同身材瘦小的拿破仑单独会面了。这次会见持续了几个小时。为拿破仑生命提心吊胆的副官们挤满了旁边的小屋，他们很清楚卡杜达尔为了自己的事业早已将生死置之ใ度外，他是什么事都干得出来。然而什么事也没生。拿破仑提议给他一个将军头衔，加入军队，同外国人作战，卡杜达尔表示拒绝，返回旺代。
1้８oo年1月1o日，拿破仑表公告：“再也不能ม容忍那些没有信仰、没有祖国、堕落为外国敌人的可耻工具的人，拿起武器反对法国的人。"他号召平叛军队打一场快而漂亮的仗，对土匪们绝对不能ม手软，对其同党及其姑息养奸者一律格杀勿论。在军队的严厉镇压下，一度十分猖獗的叛乱ກ在拿破仑上台不到３个月的时间内便被迫定了。乔๒治·卡杜达尔顽固地拒绝投降，逃到เ英国去了。
为了团结一切可以团结的力量，拿破仑对亡命者采取了宽容的态度。他取消เ了禁止贵族和亡命者亲属充任国家公职的规定。1８oo年３月３日政府作出决定，不许在逃亡者名单上再增添新的名字，即1７９９年1２月２５日以后出国的人不许以逃亡者对待。允许逃亡者回国。这样，公开的保王党人、立宪派人士、雅各宾党人以及几次政变中逃亡国外的人士纷纷回国了。拿破仑对亡命者的宽容态度使王党分子对他产生了幻想，他们希望与拿破仑合作，一起恢复波旁王朝。1８oo年２月２o日，当时的普罗旺斯ั伯爵（即以后的路易十八）给拿破仑写了下面这封信：
无论他们明显的行为是什么，像您这样的人，先生，是决不至于感到惊慌的。您接受了显要的职位，我为此感谢您。您比任何人都更明了保证一个伟大的国家的幸福所必须的力量和权力。从法兰西自身的暴力拯救法兰西，您就会满足我内心的要愿望。把国王还给法国，后世子孙将祝祷您身后之ใ名。您对于我的国家永远是最需要的，决不能解除要职，那是对我的家庭和我本人的恩德。”
拿破仑将信弃置一旁，他对布里昂道：“波旁派分子如果以为我是充当蒙克1้这个角色的人，就大大自欺了。”
乔๒治·蒙克（16o８—16７o），一手策划查理二世复辟的英国将领ๆ。
6月４日，普罗旺斯伯爵又寄来了第二封信，信中说：“将军，您要知道，您享有我的尊敬已久。如果您怀疑我的谢意，提出您需要的酬劳并确定您朋辈的酬劳。至于我的原则，我是个法国人，我生性仁慈，出于理性的吩咐，我会更仁慈。不，洛迪、卡斯蒂里恩、阿尔科拉等地的战胜者，意大利ำ和埃及的攻占者，决不至于徒爱虚名而不要真正的荣耀。但是您在浪费宝贵的时间。我们可以保证法兰西的荣誉。我说我们，因为我需要波拿巴的帮助，而他没有我也将一事无成。将军，全欧洲正在观望您。荣誉在恭候您，我又是岂不及待地要为我们的百姓恢复和平。”
拿破仑决定断掉这位伯爵的复辟念头，他亲笔写了下函：殿下：我已收到您的来函，感谢您说到我时表现的宽容态度。您不应该想要回到เ法国，您要回法国必须踩过1o万死尸。为ฦ法兰西的安宁和幸福而牺牲您的利益吧，历史会公正对待您的。我对您家族的不幸并非无动于衷，而且将乐于获悉您对您退隐生活所要求的一切。”
波旁派一计不成，又生一计，他们派遣美艳动人的德·吉什公爵夫人前往拿破仑在巴黎郊区的宅第马尔梅松。德·吉什公爵夫人相信自己凭着妩媚的容貌、漂亮的眼睛以及能ม说会道的小嘴一定会完成波旁้王朝交给她的使命。约瑟芬设午宴款待了她，席间谈到伦敦，谈到เ流亡者以及波旁้王朝的那ว些亲王们，这位美丽的夫人转达了亲王们的意思：如果第一执政重建波旁王朝，亲王们将在卡鲁塞尔凯旋门那里建筑一座有拿破仑铸像的巨大圆柱。拿破仑迅回答道：“第一执政的尸体将是这圆柱的座基。"当天夜里，德·吉什公爵夫人就接到离开巴๒黎的命令。第二天，她走上了通向边境的大道。
既然收买不成，王党分子决定采取另外一种手段。
1８oo年1２月２４日即雪月３日下午４时许，日头西斜，余辉中ณ一匹黝黝的老黑马拉着一辆双轮破篷车缓缓前进，赶车的三个人都穿着蓝色罩衫，一副鬼鬼祟祟的样了。他们穿过克雷利ำ大街，又走过胜利广场，最后到达圣·尼凯斯大街，在这里可以看见杜伊勒里宫。这时夜幕已经降临，王宫的所有窗户都亮着灯。这三个ฐ人将马车停放在一个阴暗的角落里，随即开始精心布置一项暗杀拿破仑的阴谋。他们把车篷里放了满满一桶火药，然后雇来一个1４岁的小女孩，嘱咐她把马车横在大路上，并要她看着马，不要让马移动。
这天晚上，海顿的大型圣乐《创世》在歌剧院次演奏。拿破仑对音乐器有爱好，准备同夫人一同前往观看。晚上８点，拿破仑的车队从杜伊勒里宫出了，圣·尼凯斯大街上顿ู时沸腾起来了，行人停下脚๐步，临街的窗户一扇扇地被打开，人们一个个ฐ探出身子，高呼着：“他在那里！""ิ拿破仑万岁！""第一执政万岁！"拿破仑的车队过来了，走在前面的是卫队，清一色的彪形大汉。后面的马车里端坐着第一执政和三位陪伴的将军。再后面的是约瑟芬的马车，因出门时为ฦ着装耽误时间太久，她与拿破仑的马车拉开了很长一段距离。
拿破仑的车队朝着那ว个装ณ满炸药的马车飞奔而来，那ว个看车的小女孩已๐被这威武的场面吓得目瞪口呆。站在姑娘旁边的那ว个赶车人疯狂地翻动了一下篷布下面的东西，便慌忙躲到远处。刹那间，一声巨响震撼了大地，一道耀眼的光芒一闪即逝。石块、玻璃碎片、砖头、瓦片、泥块，犹如一场稠密的冰雹铺天盖地般地溅落下来。痛苦的吼叫声、焦灼的呼救声响彻漆黑的夜空。一群刚刚还是高高兴兴地欢呼着拿破仑的人都被炸得血肉模糊，看车的小女孩已被炸成碎片。炸药是在拿破仑和约瑟芬的马车之ใ间爆炸的，拿破仑毫无损伤，唯有约瑟芬车内的博阿尔内小姐手上受了点轻伤。拿破仑的马车绕过圣奥诺莱大街的转角后停下，大家在等待第一执政的命令，拿破仑冷静地说：“去歌剧院。”
在歌剧院，拿破仑坐在他的包厢里，安详而平静。警务大臣富歇在他身旁。他一面用观剧ຕ镜观看听众，一面说：“那些恶棍，竟想炸死我。拿圣乐说明书给我。”
雪月３日晚的爆炸事件使８个行人当场死去，6o多人受伤，其中２o人也先后丧命。阴谋的残酷激起普遍的恐怖和愤慨。在此之前，警方แ已破获暗杀第一执政的案件达３o起以上。这些暗杀案件中，有的是不满独裁的雅各宾党人干的，有的则是保王党人干的。为了镇压恐怖活动，拿破仑在全国范围内采取了坚决措施，逮捕、审讯、枪决、流放一批又一批王党分子和雅各宾党人，雪月３日的谋杀者也被送上断ษ头台。
马伦哥战役
拿破仑在卢森堡宫宣誓就职时，法国还处在第二次反法联军的包围中。他深知一个新政府在旧ງ政府的废墟上兴平时，如果国家处于战争状态，那ว笼络人心的最好机会是提出和平的前景，因为和平总是民众向往的目标。所以，尽管拿破仑内心希望用战争解决一切，但他表现出来的却是一副渴望和平的面孔，他一上台，就急于照会各国他已๐进入执班府，并向英、奥、俄三国君主建议尽快停止军事行动。1７９９年的圣诞节，他向英王乔治三世和奥皇弗兰西斯ั二世出私人函件，暗示以现状之基础来和平解决一切重要问题的时机已经成熟，他还暗示奥军应照原有和约撤回到阿迪杰河一线。英国国王没有理睬拿破仑的去信，只让大臣回复了一封傲气十足的函件。这位大臣在这份函件中说：“如果法国真诚渴望和平，那么เ，现实的和持久的和平的最好和最自然的保障就是让法国原来的王室复位。这个王室统治法国已达数百年之久，并使法国国内安享太平，在国外备受尊敬。无论何时王室统治的恢复将立即排除和平谈判的一切障碍。"同时，英国相威แ廉·皮特在下院猛烈攻击拿破仑，他用古罗马西塞罗的话坚决拒绝和谈建议：“为什么我再一次拒绝媾和呢？因为ฦ这种和平是不可靠的、危险的，因为这种和平是不可能缔结的。"得到英国的答复后，拿破仑高兴地搓着手对他的外交部长塔列兰说：“这是再好不过的了，这一回答充分地满足了我。英国需要战争，英国将会得到เ它。是的，是的，殊死的战争！”1８oo年1月７日，拿破仑向军队宣布道：“军人们，对于你们，我不仅要求你们保卫疆土，我们还必须侵入敌国。"同一天，他任命弟弟吕西安为内政部长，这样他就可以控制警察、国内治安和新闻检查。次日，他下令成立一支执政警卫军，共２1้oo人，包括两个榴弹步兵营、一个步兵连、两个骑兵连和一个炮兵连。这支队伍以后就展成皇帝的禁卫军。
奥地利也拒绝了拿破仑的和谈建议，因为这时的奥地利军事上正处于优势，奥地利又一次成为意大利的主人并企图从意大利动对法国的进攻。1８oo年４月，梅拉斯的奥军把萨沃纳附近的法军截为两段，絮歇的部队被迫向尼斯ั撤退，被赶回到瓦尔河畔；另一支马塞纳的部队也被围困在热那ว亚要塞内。尽管马塞纳和副手乌迪诺、苏尔特奋勇作战，但终究抵挡不住两ä倍于他们的敌军进攻，处境十分困难。奥军司令部计划是尽快迫使马塞纳投降，以便大军西指，攻入尼斯、普罗旺斯、甚至萨瓦，围歼絮歇部队，唤起南方保王党的叛乱，造成法国的瘫痪。奥军司令部的计划是有条件实现的，但是，其作战计划却有一个很大的漏洞，那就是梅拉斯将奥军庞大的兵力置于敌人可以从后方（即瑞士）打击的地方。这一漏洞没有逃过拿破仑的鹰眼，他决定采取一项全新的而且极为大胆的作战计划。
拿破仑命莫罗指挥的莱茵战线的1o万大军在巴伐利亚一带活动，同克顿率领ๆ的奥军作战，以吸引住奥军的力量。他自己则采取一个冒险的行动，他不去顺应敌人的设想，去援救在热那亚陷入困境的马塞纳部队，而是从瑞士经过大圣伯纳德山口进入意大利，从后方袭击梅拉斯ั军队，夺取他的各个仓库、辎重库和医院，截断梅拉斯和奥地利的联系，迫使梅拉斯在被动的状况下作战。而梅拉斯奥军的失败就能ม使意大利的整个奥军覆灭，使法军重新赢得意大利。执行这个计划要求行动迅、极端秘密和非凡的勇敢。但是，保守秘密是非常困难的，到处有英国和奥地利的间谍。必须瞒住他们，或者把他们引入歧途，为此，拿破仑决定制造假情报。
1月２５日，拿破仑对他的6军部长贝尔蒂埃下了一道手谕：“我的意图是要组成一个ฐ预备军团，由第一执政亲自指挥。它应分成３个军，每军又分２个师。"6个星期后，拿破仑又进一步指示道：“成立一个ฐ预备军团，共6万人。由第一执政直接指挥。该军团将以第戎为集中ณ地。”
３月初，预备军团在第戎组成，似乎ๆ是作为莱茵军团的增援。许多外国间谍迅赶往第戎。４月初，外国间谍在那里现了许多没有军队的司令部ຖ。这个所谓的预ไ备军团大约只有３ooo到6ooo的新า兵和服役过期的老兵，其中还有一些残废军。间谍们看到拿破仑于５月6日检阅了这支人数不上７ooo、大部分没有穿制服的预备军。这些情报飞快地传到伦敦、维也纳和意大利，人们得出一个结论：预ไ备军并不存在。于是，各种讽刺๐拿破仑预备军团的漫画出现了，其中ณ一幅画中画着一个1２岁的孩子和一个装着假腿的残废军人，旁边写着"拿破仑的预备队"ิ。梅拉斯也由此断言：“实际上没有什么预备队，只是妄图用一支六七千人的新า兵和残废军人来迷惑我们，迫使我们解除对热那亚的包围，诱骗我们扔掉真正的捕获物而追捕影子。"ิ正当联军司令部兴致勃勃地嘲笑拿破仑的时候，在法国东南部，一支真正的预备军正秘密而迅地集中在瑞士边境。
由á于新宪法中规定第一执政不得亲自指挥军队，拿破仑命令贝尔蒂埃为预备军团总司令，卡尔诺继任6军部长1。拿破仑坐镇巴黎，通过卡尔诺向贝尔蒂埃下达了一连串命令，贝尔蒂埃实际上只是一个名义上的司令。不久，拿破仑接到贝尔蒂埃从日内瓦来的急件，要求他迅赶赴军营，拿破仑决定离开巴๒黎。
卡尔诺在果月1８日政变中逃亡瑞士，1้７９９年1２月被允许返回法国。
这时马塞纳的处境日益危急。４月２o日，他派出一名少校偷越英国海军封锁线，向拿破仑求援。５月５日，这名少校到达巴黎面谒拿破仑，拿破仑随即给马塞纳回复了一封短信，信中ณ道：“预备军团正在加前进，我本人今夜将起程。我希望你能坚守，至少应守到เ５月３o日。”
为了掩人耳目，防止别人知道他是前去指挥军队，离开巴黎前夕，他当着另外两名执政和各部长的面对吕西安说：“明天写出致各省长的通报，你和富歇送给各报去表，只说我已出去第戎视察后备军。你还可以说，我或许最远要去日内瓦，但是要肯定说我离开巴黎不出1้５天。你，康巴塞雷斯，明天主持国务会议。我不在时，你是政府脑。对国务会议也这么说：我离开是短起的，除此之ใ外，别讲任何事。让国务会议确信我对他们的工作完全满意，我希望他们继续下去。你同时还可宣布我已任命约瑟夫为国务会议成员。出什么เ事的话，我会像雷电一样赶回来。我把法国的一切重大利益全托付给你了，我希望不久ื维也纳和伦敦就会谈起这件事。”
５月6๔日凌晨２点，拿破仑一行出了。他们是沿着勃艮第大路行进的。沿途拿破仑谈兴甚浓，他大谈古代的军人，如亚历山大、凯撒、西庇阿和汉尼拔，他对这些统帅的地位和各人的手段研究得非常透彻。当问及他是更佩服亚历山大还是凯撒时，他说：“我把亚历山大列入第一流，我也佩服凯撒在非洲的漂亮仗。我更钦佩那位马其顿王的理由á是他对亚洲战役的构想，尤其是其实施。责怪这位王爷花７个月时间围攻泰尔是没有战争观念的。要是我自己，如有必要我会在那里留７年。这是个庞大的课题，就我来说，我认为围攻泰尔，攻占埃及，以及进军阿蒙绿洲是这位伟大主将的天才的证明。他在格兰尼格斯和伊萨斯ั两战中只挫败了波斯王的先头部队，他愿意给后者时间集中起全部兵力，以便一击之下推翻这个他刚刚ธ动摇了的庞然大物。亚历山大若是穷追大流士进入波斯各洲就会脱离后援，只遭遇零星小部队而把他拖进沙漠，使他的军队迷路。坚持攻下泰尔使他保持了同希腊的交通，他为希腊立下那样多的功绩。他之挚爱希腊正如我热爱法兰西一样，他把自己的荣耀寄托于希腊的荣耀。他占领了当时十分强大富庶的埃及省，迫使大流士前来保卫或者挽救这个地方แ，在行军途中遭遇他。他自称朱匹特之子，他的行动方式对他算计东方人的烈性是有用的。我们知道这一点怎样帮助了他。最后，他死时才３３岁，身后留下多大的名声！”这一番对古代名将精辟的评价和独到的见解使同行人对第一执政佩服得五体投地。
５月７日，拿破仑一行到เ达第戎。在这里，他以盛大的仪式检阅了那支六七千未经训练的、衣着不全的部ຖ队。２个小时以后，他们又飞快赶往日内瓦。在日内瓦，拿破仑会见了派去探测圣伯纳德大山口的工程师马来斯戈ຖ，马来斯戈如实地向拿破仑汇报了军队经由圣伯纳德大山口进入意大利的种种困难和骇人情景。"能够通过吗？”拿破仑打断这位工程师的叙述问道。"勉强可以通过。"ิ马来斯戈答道。"ิ很好"，第一执政说：“我们前进吧！”
５月1３日，拿破仑到达洛桑，检阅了真正预备军团的前卫部ຖ队。这时，拿破仑收到เ马塞纳在４月２９日写的一封信，这封信是透过敌线偷送出来的。信中道：“看在上天的份上赶快救我！这个城市已经受到海6๔两面的封锁……我只有３o天的口粮。"拿破仑回信道：“我已๐到洛桑两天。全军都在行动……我深知你处境困难，但使我放心的却是有你在热那亚。在这种时候，你一个人可以抵得２万人。”
拿破仑下定决心学习古时汉尼拔之所为，冒阿尔卑斯大山的一切危险和困难突入意大利。为了比较容易搜集行军所需粮秣储备，使进军能够更迅地完成，以及使敌人摸不清行军目的，拿破仑命令军队采取不同路线分四路前进。他自己้率３５ooo人的主力，携带大炮，翻越大圣伯纳德山口，蒙塞率1５ooo人的左翼经由圣哥塔出山，杜劳的５ooo人的右翼取道切尼山方แ向，左右两路军均配合主力行动。沙布南率５ooo人穿越小圣伯纳德山口，与主力会合于奥斯ั塔。
５月1５日，各路队伍均已出动。拿破仑所率的这支由á骑兵和步兵组成的军队任务最为艰巨，它载负着战斗所需的全部ຖ军火，包括４o门野战大炮在内。拉纳带领先锋部队在前开路，贝尔蒂埃和拿破仑亲自指挥后卫，因为后卫有炮兵随行，这是整个部队的威力所在。由于道路条件恶劣，部队只能沿一条道行进。漫长的队伍犹如一条灰色的长蛇，在高山深谷中缓缓移动。到เ了圣彼埃，道路消失了，到เ处是悬崖峭壁和深深的积雪，部队只好攀登怪石嶙峋的、堆满积雪的山脊强行前进。每个人心中都十分紧张，行动也格外小心，生怕稍有不慎，摔进无底深渊。头顶的冰川也有随时崩落的危险。
大炮和弹药的运输最为困难，原先准备用来搬运大炮的雪橇已完全不顶用了。幸好当地农民教给拿破仑一个办法：把松树干按尺码锯断，锯成两ä半，将中间掏空，然后从炮车上将炮管卸下，装在掏空了的树干中捆好，炮尾朝前，炮口朝后，再在炮尾环上系上绳索，由身强力壮的士兵拖着它前进。架炮的车轮则由骡子驮着行走。这个ฐ绝妙的主意使得炮兵得以顺利前进。
拿破仑为ฦ了鼓舞那些拖拉大炮的士兵，自己不骑骡子，而是与士兵一同步行。前面的队伍不敢稍停一下喘口气，因为一停步就会使后面处在万分危殆的峭壁边缘的队伍陷于混乱。前军的脚步和蹄印把深及膝盖的冰雪踩成稀泥状，后军须在其中蹒跚前行。攀登阿尔卑斯山的艰难困苦是难以用语言形容的。可面对如此巨เ大的困难，拿破仑表现得异常沉着冷静和若无其事。他一面步行，一面同向导们聊天，询问当地居民的生活状况，问他们何以为生，意外事故是否像他们说的那样频繁。他与向导们谈话的神态就好像是在巴๒黎大街上散步时与人拉家常似的。
５月16日，拉纳前锋抵达秀丽的奥斯塔山谷，其他部队迅地接踵而降。到เ这时为止，拿破仑的军队不曾遇到任何抵抗，梅拉斯将军完全蒙在鼓里。1７日，法军抵达沙蒂隆。在这里遇上了小股奥军。面对突如其来的法军，奥军惊慌失措，他们做梦也没想到这个方向也会冒出一支法国军队。由于仓促应战，再加上兵力悬殊，奥军很快败北而逃。